RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 TSC22D3Q99576 134 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 UPB1Q9UBR1 384 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 COPS3Q9UNS2 423 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 RAXQ9Y2V3 346 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 SPTBN2O15020 2390 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GTH9 108 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PPL8 197 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM212A6NML5 194 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 UPK3AO75631 287 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ARL6IP5O75915 188 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ATE1O95260 518 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 RAF1P04049 648 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 H2BFMP0C1H6 154 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 EDNRAP25101 427 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 MMP16P51512 607 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 PSMD7P51665 324 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H3AP68431 136 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 CXADRP78310 365 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 FMODQ06828 376 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 AQP6Q13520 282 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 MEP1BQ16820 701 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TP53I3Q53FA7 332 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 LIPNQ5VXI9 398 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 CARD17Q5XLA6 110 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 MED12LQ86YW9 2145 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ST7LQ8TDW4 575 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ABHD3Q8WU67 409 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 GHSRQ92847 366 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 EXTL1Q92935 676 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 OR51E2Q9H255 320 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 MMP27Q9H306 513 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 CRLF2Q9HC73 371 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 GPR35Q9HC97 309 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 LHX6Q9UPM6 363 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF878C9JN71 531 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 GPX5O75715 221 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ABHD16AO95870 558 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 PDGFAP04085 211 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ISG15P05161 165 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF12P17014 697 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 KLK2P20151 261 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TIMP3P35625 211 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 RORCP51449 518 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 VBP1P61758 197 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 PMP22Q01453 160 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TGFBR3Q03167 851 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 LSAMPQ13449 338 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TAF13Q15543 124 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 ARL9Q6T311 187 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 SSX6Q7RTT6 188 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 BOD1Q96IK1 185 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 FOXB1Q99853 325 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-211ENST00000425989 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.48□□□□□ -1.05
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