RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 TEX30Q5JUR7 227 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RPTNQ6XPR3 784 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GGNQ86UU5 652 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PHYHIPQ92561 330 aa5.9□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 BORCS5Q969J3 196 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.9□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 OR8B4Q96RC9 309 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 MROQ9BYG7 248 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SEC16AO15027 2179 aa5.9□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 USP24Q9UPU5 2620 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF879B4DU55 563 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 H0YC42 278 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 GPR171O14626 319 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 QDPRP09417 244 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 INHBBP09529 407 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 SDC2P34741 201 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 OPRL1P41146 370 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 TNFSF10P50591 281 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 BMXP51813 675 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 MXD1Q05195 221 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 MEP1BQ16820 701 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 PCK2Q16822 640 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 LIPNQ5VXI9 398 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 TRILQ7L0X0 811 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 TPRA1Q86W33 373 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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HDAC8-211ENST00000415409 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 TEX19Q8NA77 164 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 OR52N5Q8NH56 324 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 OR10D3Q8NH80 312 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 RNF128Q8TEB7 428 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC8-211ENST00000415409 THRSPQ92748 146 aa5.89□□□□□ -1.47
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