RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390897.1

RNU6-127P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 127, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-127P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-127P-201ENST00000390897 FN3KRPQ9HA64 309 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 POPDC2Q9HBU9 364 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 OR2S2Q9NQN1 319 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SMOXQ9NWM0 555 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 COMMD8Q9NX08 183 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 FETUBQ9UGM5 382 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SUN2Q9UH99 717 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 LAMP5Q9UJQ1 280 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 LIPT1Q9Y234 373 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TTLL3Q9Y4R7 772 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CRB1P82279 1406 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 PTPRUQ92729 1446 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 VWDEQ8N2E2 1590 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SEC16AO15027 2179 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NSD2O96028 1365 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CLUHO75153 1309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ZMYM6O95789 1325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SHANK1Q9Y566 2161 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 LRRK1Q38SD2 2015 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NACADO15069 1562 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 RGS12O14924 1447 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 A0A0U1RRA0 63 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 A0A1B0GTI1 187 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 A0A1W2PRG6 482 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 RNF222A6NCQ9 220 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 IZUMO1RA6ND01 250 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 FAM47DPA6NHR8 397 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ARHGAP42A6NI28 874 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 OR5B21A6NL26 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 GABRR3A8MPY1 467 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 KRBOX1C9JBD0 128 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NPIPA7E9PJI5 369 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 FNDC10F2Z333 226 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 F5H5T6 163 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 F8W036 122 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CTAGE5O15320 804 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CREB3O43889 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SSX5O60225 188 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SH3BP5O60239 455 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SOX15O60248 233 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CDH16O75309 829 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ENTPD6O75354 484 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 RDH16O75452 317 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TM7SF2O76062 418 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SEMA3DO95025 777 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 KCNK2O95069 426 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NPPAP01160 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 IGHV1-46P01743 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 IGHG2P01859 326 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 IGHG4P01861 327 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 OPN1LWP04000 364 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ARG1P05089 322 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 KRT8P05787 483 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 C2P06681 752 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ADRB2P07550 413 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CD3GP09693 182 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 NPIPA8P0DM63 369 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CD28P10747 220 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 ERGP11308 486 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 MLNP12872 115 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 TNNI3P19429 210 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 PGCP20142 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 RAB3AP20336 220 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 KITLGP21583 273 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 MSR1P21757 451 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 PCMT1P22061 227 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 CHMLP26374 656 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-127P-201ENST00000390897 GCAP28676 217 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms