RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384016.1

RNU6-484P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 484, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-484P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-484P-201ENST00000384016 LINC00574Q9H8X3 128 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 MEAF6Q9HAF1 191 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SLC17A7Q9P2U7 560 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SPASTQ9UBP0 616 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CHMP2BQ9UQN3 213 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TMED5Q9Y3A6 229 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 COL4A1P02462 1669 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 OR6C74A6NCV1 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 F6UB75 175 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TM7SF2O76062 418 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 AIFM1O95831 613 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TGFAP01135 160 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TNNI3P19429 210 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 NT5EP21589 574 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 DRD5P21918 477 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 UGT2B15P54855 530 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CCNA1P78396 465 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CBX3Q13185 183 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SP6Q3SY56 376 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TCF24Q7RTU0 167 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SLC38A6Q8IZM9 456 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 KDM8Q8N371 416 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 OR10T2Q8NGX3 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SLC13A3Q8WWT9 602 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 ATP6V1E2Q96A05 226 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TMEM186Q96B77 213 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 OTUB2Q96DC9 234 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CABS1Q96KC9 395 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 C7orf34Q96L11 122 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 GPR82Q96P67 336 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 MS4A4EQ96PG1 132 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 OR8B4Q96RC9 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 BFARQ9NZS9 450 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 MEMO1Q9Y316 297 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 DENND4AQ7Z401 1863 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 STRCP1A6NGW2 1772 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 LANCL1O43813 399 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 KERAO60938 352 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SLC22A5O76082 557 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 IGKV1-39P01597 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 IGHV3-11P01762 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 IGKV1D-39P04432 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CGB7P0DN87 165 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 LYNX1P0DP58 116 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CD28P10747 220 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 ETS1P14921 441 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 FUT1P19526 365 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 RAB3BP20337 219 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 GNA11P29992 359 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CEACAM3P40198 252 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 EIF1P41567 113 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CDKN2DP55273 166 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CCNJQ5T5M9 372 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 ZNF470Q6ECI4 717 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 RAET1GQ6H3X3 334 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 DEGS2Q6QHC5 323 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CCDC80Q76M96 950 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 NUDCD3Q8IVD9 361 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SPC24Q8NBT2 197 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 UBE2E3Q969T4 207 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 HSFY1Q96LI6 401 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TCHPQ9BT92 498 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 FICDQ9BVA6 458 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 GGTLC1Q9BX51 225 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 KCNJ16Q9NPI9 418 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SDK1Q7Z5N4 2213 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 OR5H1A6NKK0 313 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 C15orf65H3BRN8 121 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 L7N2F9 121 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 SYNGR2O43760 224 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 PAHP00439 452 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CD3GP09693 182 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CD37P11049 281 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-484P-201ENST00000384016 CCNB1P14635 433 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms