RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380176.7

PDLIM5-204, Transcript of PDZ and LIM domain 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDLIM5, Length 3,098 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5-204ENST00000380176 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 BIVMQ86UB2 503 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 BEST4Q8NFU0 473 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 IFI44Q8TCB0 444 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 RNF138Q8WVD3 245 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 SCMH1Q96GD3 660 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 CMTM3Q96MX0 182 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 SLITRK2Q9H156 845 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 RCE1Q9Y256 329 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 LRP12Q9Y561 859 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 PHYHO14832 338 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 TMEM205Q6UW68 189 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 POC1BQ8TC44 478 aa7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 GZMKP49863 264 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 PTGS2P35354 604 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 ART1P52961 327 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 HSF1Q00613 529 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 ZP4Q12836 540 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDLIM5-204ENST00000380176 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 A0A1W2PNR3 127 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 GABARAPH6UMI1 98 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 MASP2O00187 686 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 LMX1BO60663 402 aa7.12□□□□□ -1.27
PDLIM5-204ENST00000380176 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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