RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR2G2Q8NGZ5 317 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR52N5Q8NH56 324 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR14A2Q96R54 314 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 COQ7Q99807 217 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 EXO5Q9H790 373 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CENPMQ9NSP4 180 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 LRP12Q9Y561 859 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 LHFPL6Q9Y693 200 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 K7EM74 188 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 DOK2O60496 412 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ROM1Q03395 351 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TRAM1Q15629 374 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SYT9Q86SS6 491 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 NR2C2APQ86WQ0 139 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MEIOBQ8N635 442 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MED18Q9BUE0 208 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 AKIP1Q9NQ31 210 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A13Q9Y226 551 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF281Q9Y2X9 895 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 BSNQ9UPA5 3926 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ACOT7O00154 380 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 PDGFAP04085 211 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 CD1AP06126 327 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 GALP22466 123 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 KIR3DL2P43630 455 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 AAED1Q7RTV5 226 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 OR10S1Q8NGN2 331 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 OR10AC1Q8NH08 325 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 FNDC9Q8TBE3 224 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 RNF128Q8TEB7 428 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 POLE4Q9NR33 117 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC4AQ9UMR7 237 aa13.58□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 OR4C45A6NMZ5 311 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 PIN1P1O15428 100 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 WDR38Q5JTN6 314 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 C10orf128Q5T292 105 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 CFAP77Q6ZQR2 320 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 LINGO2Q7L985 606 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 MFSD4AQ8N468 514 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 FNDC8Q8TC99 324 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 KCNN2Q9H2S1 579 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 SIAEQ9HAT2 523 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 DHHO43323 396 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 TMCC2O75069 709 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 RIDAP52758 137 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 OR10A3P58181 314 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 INAQ16352 499 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 TUSC5Q8IXB3 177 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC18Q8N456 261 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 SLAMF6Q96DU3 332 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF416Q9BWM5 594 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ASH2LQ9UBL3 628 aa13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 MED12LQ86YW9 2145 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 DOCK7Q96N67 2140 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ACOD1A6NK06 481 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN25C9JDP6 229 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 TFECO14948 347 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 RER1O15258 196 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 GPRIN2O60269 458 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ACTL6AO96019 429 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-9P01782 118 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 BCL2A1Q16548 175 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 KCNMB1Q16558 191 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 SNX29P2Q8IUI4 249 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 EGFL6Q8IUX8 553 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 C4orf45Q96LM5 186 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 CRLF2Q9HC73 371 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 NOX4Q9NPH5 578 aa13.56□□□□□ -0.24
CASQ1-201ENST00000368078 CAMK2AQ9UQM7 478 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms