RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 H0YAE9 185 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RAB36O95755 333 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PATE4P0C8F1 98 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PTAFRP25105 342 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 FMO3P31513 532 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF83P51522 516 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PIGFQ07326 219 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MEP1BQ16820 701 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PCK2Q16822 640 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TTC23Q5W5X9 447 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 BBS1Q8NFJ9 593 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR6K6Q8NGW6 343 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ADI1Q9BV57 179 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC182A6NF36 153 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 DPRXA6NFQ7 191 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TVP23AA6NH52 213 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 M0R1B8 84 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MPZL2O60487 215 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-DQA2P01906 255 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA5P05154 406 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CECR9P0C854 216 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF823P16415 610 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 GABRB1P18505 474 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CD40P25942 277 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H3AP68431 136 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PSG4Q00888 419 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IL18R1Q13478 541 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 APOFQ13790 326 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL12Q53G59 568 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TEX30Q5JUR7 227 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 GID4Q8IVV7 300 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF511Q8NB15 262 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MARVELD3Q96A59 401 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 APOL4Q9BPW4 351 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf198Q9H425 327 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RNF121Q9H920 327 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CTAG2O75638 210 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CELA3BP08861 270 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 GSTT1P30711 240 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CAPGP40121 348 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ENTPD1P49961 510 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 AQP4P55087 323 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ADAM8P78325 824 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 BSPH1Q075Z2 132 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TMED1Q13445 227 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 GGTLC2Q14390 218 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RAB39AQ14964 217 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OCLNQ16625 522 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF691Q5VV52 312 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OTPQ5XKR4 325 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF787Q6DD87 383 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TIGD4Q8IY51 512 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ENTHD1Q8IYW4 607 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 GJC3Q8NFK1 279 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CYGBQ8WWM9 190 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2FQ969M7 185 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 INTS14Q96SY0 518 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TEAD3Q99594 435 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms