RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1N1Q8NGS0 311 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 LHFPL5Q8TAF8 219 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB13Q8WXK3 278 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MGAT4CQ9UBM8 478 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 GLS2Q9UI32 602 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 V9GY05 133 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NBASA2RRP1 2371 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 L7N2F9 121 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QL1O75973 258 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CFDP00746 253 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPSP04118 112 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3-11P04433 115 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MGAT2Q10469 447 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF626Q68DY1 528 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52I2Q8NH67 350 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SLITRK2Q9H156 845 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCP1Q9H5V8 836 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NOX4Q9NPH5 578 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD10Q9NXR5 420 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 LUZP4Q9P127 313 aa23.63■■□□□ 1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 GYPBP06028 91 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZTK2 550 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF550Q7Z398 422 aa23.63■■□□□ 1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A38Q96DW6 304 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DDOQ99489 341 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10A4Q9H209 315 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R10Q9NYW0 307 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPK0 400 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC3O15145 178 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS11O94810 467 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX2-2O95096 273 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CALCRP30988 508 aa23.62■■□□□ 1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ULK3Q6PHR2 472 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 APOOLQ6UXV4 268 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SFXN2Q96NB2 322 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 LIN7BQ9HAP6 207 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FLRT3Q9NZU0 649 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PIPOXQ9P0Z9 390 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF462Q96JM2 2506 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 HMSDA8MTL9 139 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 KRBOX1C9JBD0 128 aa23.61■■□□□ 1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB6O95139 128 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 S1PR1P21453 382 aa23.61■■□□□ 1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 ACER2Q5QJU3 275 aa23.61■■□□□ 1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf40Q8IXQ3 194 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BEST3Q8N1M1 668 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 GRHL3Q8TE85 626 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 HAVCR1Q96D42 359 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DERL3Q96Q80 235 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXJ3Q9UPW0 622 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2M5A3KFT3 312 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALNT1O75752 331 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 WDPCPO95876 746 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PTH2RP49190 550 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM69Q5SWH9 247 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFL2Q6UWQ7 119 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DNM1P46Q6ZS02 220 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT9Q86SS6 491 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RFLNBQ8N5W9 214 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MIB2Q96AX9 1013 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK2AP1O14519 115 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TACSTD2P09758 323 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRA3P34903 492 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ART1P52961 327 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BIKQ13323 160 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A25Q6KCM7 469 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IZUMO1Q8IYV9 350 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SDR9C7Q8NEX9 313 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K13Q8NH42 304 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 THEM6Q8WUY1 208 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SGTBQ96EQ0 304 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO34Q9NWN3 711 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FLVCR2Q9UPI3 526 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINI2O75830 405 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TOXO94900 526 aa23.59■■□□□ 1.37
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