RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SCAIQ8N9R8 606 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF519Q8TB69 540 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 WNT2BQ93097 391 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TMED9Q9BVK6 235 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 VDAC3Q9Y277 283 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 VPS13CQ709C8 3753 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR2M5A3KFT3 312 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 E9PI62 339 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 J3QLW9 94 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 GABRPO00591 440 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SELENOFO60613 162 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CDRT1O95170 752 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RENP00797 406 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF19P17023 458 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PYCR1P32322 319 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CLDN20P56880 219 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZP4Q12836 540 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 BCL2A1Q16548 175 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RAET1LQ5VY80 246 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR2T4Q8NH00 348 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 POC1BQ8TC44 478 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 FNDC8Q8TC99 324 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 DDIT4LQ96D03 193 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NUAK2Q9H093 628 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SNTG1Q9NSN8 517 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ABCA4P78363 2273 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 C11orf98E9PRG8 122 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 DCTN6O00399 190 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 IL18BPO95998 194 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 S100A5P33763 92 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OPRM1P35372 400 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ETV6P41212 452 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 KIR2DL3P43628 341 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 HCCSP53701 268 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ACKR1Q16570 336 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM91Q6ZNR0 172 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CDH24Q86UP0 819 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SYT14Q8NB59 555 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ARL5BQ96KC2 179 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TSSK2Q96PF2 358 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 GALNT8Q9NY28 637 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 COPS3Q9UNS2 423 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 EFNA2O43921 213 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CTAG2O75638 210 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TNFSF13O75888 250 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR6A2O95222 327 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CD40LGP29965 261 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PPP5CP53041 499 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TESK1Q15569 626 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TRAM1Q15629 374 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TIGD4Q8IY51 512 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RERGLQ9H628 205 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 FAM221AA4D161 298 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 H7C1C5 153 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OGG1O15527 345 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 IMPDH2P12268 514 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SDC2P34741 201 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 LCN6P62502 163 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR6V1Q8N148 313 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PELI1Q96FA3 418 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MARCH7Q9H992 704 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 FANCFQ9NPI8 374 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PRSS37A4D1T9 235 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 LIPT2A6NK58 231 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MS4A18H0YCH9 400 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC6-201ENST00000243108 H3BML4 177 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms