RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	ARPC3	O15145	178 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	NDUFS7	O75251	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	SERPINA5	P05154	406 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	MSR1	P21757	451 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	POU1F1	P28069	291 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	THBS4	P35443	961 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PTH2R	P49190	550 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	HSF2	Q03933	536 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CA10	Q9NS85	328 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003		H3BN98	237 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	AHCYL1	O43865	530 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	GPRIN2	O60269	458 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ENTPD5	O75356	428 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	REN	P00797	406 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OR4A8	P0C604	315 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF35	P13682	527 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	GSTM3	P21266	225 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CCNO	P22674	350 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ATP5J2	P56134	94 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PSG4	Q00888	419 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	DAG1	Q14118	895 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	MEP1B	Q16820	701 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OVOL3	O00110	214 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CST2	P09228	141 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PYCR1	P32322	319 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ADAM8	P78325	824 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PLP2	Q04941	152 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003		Q5PR19	223 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	DSCAM	O60469	2012 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	IDH3B	O43837	385 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	NR4A1	P22736	598 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-222	ENST00000637003	APLNR	P35414	380 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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