RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT6P53370 316 aa21.16■□□□□ 0.98
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CAPNS1-216ENST00000628306 GPR139Q6DWJ6 353 aa21.16■□□□□ 0.98
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CAPNS1-216ENST00000628306 MUL1Q969V5 352 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM80Q96HE8 168 aa21.16■□□□□ 0.98
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CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPB4C9JG80 1138 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 FOXB2Q5VYV0 432 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 TMIGD2Q96BF3 282 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX18Q96RF0 628 aa21.12■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A31A6NKX4 558 aa21.11■□□□□ 0.97
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