RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OTPQ5XKR4 325 aa7.47□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC18Q8N456 261 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.47□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 TUBA1AQ71U36 451 aa7.46□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 S100PBPQ96BU1 408 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TEAD3Q99594 435 aa7.46□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 WDR76Q9H967 626 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SIAEQ9HAT2 523 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 WIPF3A6NGB9 483 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SELENOFO60613 162 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-HP01893 362 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SPARCP09486 303 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CD79AP11912 226 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CCKARP32238 428 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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