RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT1P19526 365 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 FPR2P25090 351 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMXP38159 391 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DAP3P51398 398 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 MOSPD2Q8NHP6 518 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NTN4Q9HB63 628 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF16Q9NXF7 216 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HKR1P10072 659 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PCGF2P35227 344 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-25P63136 954 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG4Q00888 419 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TUSC1Q2TAM9 212 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DPP10Q8N608 796 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NSMAFQ92636 917 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 EGLN1Q9GZT9 426 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NANOGQ9H9S0 305 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ADH4P08319 380 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 GDI2P50395 445 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC3A1Q07837 685 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SGCAQ16586 387 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A8Q8IWU4 369 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB108BQ8NET1 73 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD4Q8TB40 342 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ST7LQ8TDW4 575 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX5Q96PT3 197 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP26Q9NRE1 261 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NGFP01138 241 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXL1Q12952 345 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SHISA2Q6UWI4 295 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TREML1Q86YW5 311 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10A6Q8NH74 314 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC58Q96CX6 371 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SGTBQ96EQ0 304 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT5BQ9H1J7 359 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 MSL2Q9HCI7 577 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NPHS2Q9NP85 383 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CYSLTR2Q9NS75 346 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIAL4EA0A075B759 164 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIAL4DF5H284 164 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXH1O75593 365 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV2-70P01814 119 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CD55P08174 381 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN19P0C672 248 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIAL4FP0DN26 164 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF1BP20333 461 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM34P42696 430 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1CBP62140 327 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CD47Q08722 323 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2H1Q9GZK4 316 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF696Q9H7X3 374 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF69Q9UC07 566 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NPTNQ9Y639 398 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPT2O15123 496 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPAP38571 399 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 GZMMP51124 257 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NFYCQ13952 458 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 LAPTM4AQ15012 233 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 VMACQ2NL98 169 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM27BQ5VT28 67 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DOK3Q7L591 496 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM239Q8WW34 195 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPHQ8WWY8 451 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 ICMTO60725 284 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SBK2P0C263 348 aa21.64■■□□□ 1.05
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