RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588228.5

NFIX-210, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NFIX, Length 1,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-210ENST00000588228 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 KRT77Q7Z794 578 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR10D3Q8NH80 312 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 HSD17B8Q92506 261 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 MAP6Q96JE9 813 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR2M2Q96R28 347 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TIGARQ9NQ88 270 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 GLTPQ9NZD2 209 aa14.7□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 SMIM30A4D0T7 59 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FAM166BA8MTA8 275 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 QDPRP09417 244 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 UCHL1P09936 223 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 MAGEA5P43359 124 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 PPP5CP53041 499 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CLDN15P56746 228 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CCDC190Q86UF4 302 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ST7LQ8TDW4 575 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RNF128Q8TEB7 428 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TMEM54Q969K7 222 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CEP19Q96LK0 163 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 WDFY2Q96P53 400 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.69□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 A0A1W2PPL8 197 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TMEM212A6NML5 194 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RGS5O15539 181 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF254O75437 659 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF432O94892 652 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CELA3AP09093 270 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CSNK1A1P48729 337 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CCL11P51671 97 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CAV3P56539 151 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF766Q5HY98 468 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TMEM123Q8N131 208 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 C4orf45Q96LM5 186 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CMAHPQ9Y471 501 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 LHX2P50458 406 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CCR9P51686 369 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 KCNMB1Q16558 191 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 C10orf128Q5T292 105 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF544Q6NX49 715 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 OR14A2Q96R54 314 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RCE1Q9Y256 329 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 LRP12Q9Y561 859 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF292O60281 2723 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF716A6NP11 495 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ZNF879B4DU55 563 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 NCR1O76036 304 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 WNT11O96014 354 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TNFSF8P32971 234 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 TNFSF10P50591 281 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 ACOT7O00154 380 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 CYTIPO60759 359 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms