RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 C9orf106Q8NAJ2 232 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX33Q8WV41 574 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TM9SF2Q99805 663 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLE4Q9NR33 117 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.64■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 H3BSA7 217 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHYHO14832 338 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LIPAP38571 399 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR12D2P58182 307 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LY6DQ14210 128 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GUSBP1Q15486 140 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR2A2Q6IF42 318 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYS1Q8N2H4 156 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 THEM6Q8WUY1 208 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 C4orf36Q96KX1 117 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 NELFAQ9H3P2 528 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.63■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTLL8A6PVC2 850 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMCC2O75069 709 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT33AO76009 404 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGHV3-9P01782 118 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MT-ND5P03915 603 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACSM1Q08AH1 577 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 RTL6Q6ICC9 239 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GFRALQ6UXV0 394 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GCNT2Q8N0V5 402 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OPALINQ96PE5 141 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR35Q9HC97 309 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 BABAM2Q9NXR7 383 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FREM1Q5H8C1 2179 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRR32B1ATL7 298 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 J3QLW9 94 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF19P17023 458 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 EMC7Q9NPA0 242 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM215AQ9Y5M1 114 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.62■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LALBAP00709 142 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSR1P21757 451 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 RGS6P49758 472 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LSM6P62312 80 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 EGR3Q06889 387 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEACAM16Q2WEN9 425 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TP53I3Q53FA7 332 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1orf185Q5T7R7 199 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCSK4Q6UW60 755 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 EGFL6Q8IUX8 553 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 HTRA1Q92743 480 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 NABP1Q96AH0 204 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 YIPF6Q96EC8 236 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 AMELYQ99218 206 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 C12orf49Q9H741 205 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 DOCK7Q96N67 2140 aa20.61■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPTA1P02549 2419 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRRG2O14669 202 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPR2P20594 1047 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAPZA2P47755 286 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SGCAQ16586 387 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR107Q5VW38 600 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLBQ86Z14 1044 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LINC00346Q8IVM7 164 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABHD6Q9BV23 337 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 UPB1Q9UBR1 384 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 EMC9Q9Y3B6 208 aa20.6■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMD9O00233 223 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SULT1C4O75897 302 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR3A2P47893 321 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 BDH1Q02338 343 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 STK11Q15831 433 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms