RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 H3BN98 237 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SOCS2O14508 198 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SMPD2O60906 423 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SOX14O95416 240 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PLAUP00749 431 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RENP00797 406 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IFNGP01579 166 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 HMGN1P05114 100 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ALPLP05186 524 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IGFBP5P24593 272 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CRABP1P29762 137 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GIPRP48546 466 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ALDH3A2P51648 485 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CRISP1P54107 249 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 MYBPC1Q00872 1141 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NDUFA5Q16718 116 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PGGHGQ32M88 737 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SYT14Q8NB59 555 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 DDOQ99489 341 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SYT4Q9H2B2 425 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SIAEQ9HAT2 523 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CMC2Q9NRP2 79 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 FKBP7Q9Y680 259 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CADP27708 2225 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PLCE1Q9P212 2302 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 UBL3O95164 117 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SLC2A10O95528 541 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IGKV3-15P01624 115 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF3P17036 446 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CENPAP49450 140 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 FMODQ06828 376 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 DAG1Q14118 895 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KCNMB1Q16558 191 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SHEQ5VZ18 495 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 LEG1Q6P5S2 330 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SYT9Q86SS6 491 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NABP1Q96AH0 204 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RDH12Q96NR8 316 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NMNAT3Q96T66 252 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CCL19Q99731 98 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CIB1Q99828 191 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 DLL4Q9NR61 685 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ROS1P08922 2347 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ACANP16112 2415 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 OR6C68A6NDL8 312 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZAR1LA6NP61 321 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 H7C1C5 153 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 EI24O14681 340 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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