RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577241.1

MSI2-205, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-205	ENST00000577241	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241		A0A1W2PPL8	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	DHRS12	A0PJE2	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	INHBB	P09529	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	PCSK6	P29122	969 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	NOS3	P29474	1203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	CRABP1	P29762	137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	RAD52	P43351	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	NUDT6	P53370	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	KRT80	Q6KB66	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	RASD2	Q96D21	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MSI2-205	ENST00000577241		H7C1C5	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SOCS2	O14508	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GSC2	O15499	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CST1	P01037	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CSF3	P09919	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF32	P17041	273 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GSTM3	P21266	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	LAP3	P28838	519 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PPOX	P50336	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	EFNA4	P52798	201 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SELENOV	P59797	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	LCN6	P62502	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MICA	Q29983	383 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	HTRA1	Q92743	480 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	IL20	Q9NYY1	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241		H7C1Q1	480 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GNGT2	O14610	69 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SSX4	O60224	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SLC16A7	O60669	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	NDUFS7	O75251	213 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	REN	P00797	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	STOM	P27105	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	COX10	Q12887	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	DOK1	Q99704	481 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	POMP	Q9Y244	141 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GAST	P01350	101 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	COX5B	P10606	129 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CTLA4	P16410	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	UCP2	P55851	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PSG4	Q00888	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TNK1	Q13470	666 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ARL9	Q6T311	187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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