RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 LIPAP38571 399 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ERVK-25P63136 954 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 PAX8Q06710 450 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 SCARB2Q14108 478 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MPP2Q14168 576 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 KRT71Q3SY84 523 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 SMYD1Q8NB12 490 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 OR4F5Q8NH21 305 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2FQ969M7 185 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 CITED1Q99966 193 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 BEX1Q9HBH7 125 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 HIST1H2ABP04908 130 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 F13BP05160 661 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 CRYBA1P05813 215 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 VSNL1P62760 191 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 TAF11Q15544 211 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 HIST3H3Q16695 136 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MTX3Q5HYI7 312 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF613Q6PF04 617 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ASB10Q8WXI3 467 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 NSMAFQ92636 917 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF607Q96SK3 696 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MARCH7Q9H992 704 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 NANOGQ9H9S0 305 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1B0GUS0 222 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 THY1P04216 161 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP10-3P60369 221 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PSG4Q00888 419 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RELBQ01201 579 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 FMODQ06828 376 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 NPTX1Q15818 432 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SGCAQ16586 387 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 NABP1Q96AH0 204 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 UPRTQ96BW1 309 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OR52B2Q96RD2 323 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SIAEQ9HAT2 523 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 C1RLQ9NZP8 487 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PRG6 482 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SRRM5B3KS81 715 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TIMM23O14925 209 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 UBDO15205 165 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SERPINB7O75635 380 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF205O95201 554 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 LYPD3O95274 346 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OPN1SWP03999 348 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ACADSP16219 412 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TNFSF4P23510 183 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SLC6A2P23975 617 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PSG7Q13046 419 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CDK5R2Q13319 367 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 C10orf128Q5T292 105 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MAVSQ7Z434 540 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms