RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 SMKR1H3BMG3 65 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SIVA1O15304 175 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TGM6O95932 706 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CCDC172P0C7W6 258 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NBL1P41271 181 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CCNG1P51959 295 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TIMM10P62072 90 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SP4Q02446 784 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 OR7A5Q15622 319 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 H2AFVQ71UI9 128 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 OR8K3Q8NH51 312 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NUBPLQ8TB37 319 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 FAM151AQ8WW52 585 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 LRRC39Q96DD0 335 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 C19orf60Q96EN9 201 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 OR2AG1Q9H205 316 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.7□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TSPAN11A1L157 253 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 H3BNH8 94 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 PEX7O00628 323 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NEMFO60524 1076 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 DPM1O60762 260 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 FKBP6O75344 327 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SCELO95171 688 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 UTS2O95399 124 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 AIFM1O95831 613 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 HBE1P02100 147 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TACSTD2P09758 323 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 HTR1EP28566 365 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 MXD1Q05195 221 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 GGTLC2Q14390 218 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ZNF726P1Q15940 193 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 PSMD5Q16401 504 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SGCAQ16586 387 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CCNJQ5T5M9 372 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 MLIPQ5VWP3 458 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SMIM10Q96HG1 83 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 OR5B12Q96R08 314 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 HAUS4Q9H6D7 363 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CD209Q9NNX6 404 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CLN6Q9NWW5 311 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 WDR62O43379 1518 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 AGRNO00468 2067 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.69□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NR2C1P13056 603 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 HRH1P35367 487 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 GPR1P46091 355 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NUP107P57740 925 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 LYZP61626 148 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CDH17Q12864 832 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 STK38Q15208 465 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 STK11Q15831 433 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 RPEL1Q2QD12 228 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 ANKRD22Q5VYY1 191 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 OTPQ5XKR4 325 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NPSR1Q6W5P4 371 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 OTUD6BQ8N6M0 293 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 NPBQ8NG41 125 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 DCUN1D4Q92564 292 aa3.68□□□□□ -1.82
USP15-218ENST00000552346 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms