RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514421.1

CCL28-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 3

Gene CCL28, Length 577 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-204ENST00000514421 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 NANSQ9NR45 359 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 UPB1Q9UBR1 384 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 PRSS50Q9UI38 385 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 ROS1P08922 2347 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 AKAP6Q13023 2319 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL28-204ENST00000514421 HCFC1P51610 2035 aa7.34□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 FAM221AA4D161 298 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 LRRN3E7EW58 273 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CCRL2O00421 344 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PLPP3O14495 311 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 OR7A10O76100 309 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 GOSR1O95249 250 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 LIMS3P0CW19 117 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 LIMS4P0CW20 117 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CPEP16870 476 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SLC2A5P22732 501 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 AHCYP23526 432 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 EDNRAP25101 427 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SLC6A6P31641 620 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ETV1P50549 477 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 TPBGQ13641 420 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SSX1Q16384 188 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 NIPAL3Q6P499 406 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PXKQ7Z7A4 578 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 OAFQ86UD1 273 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 UEVLDQ8IX04 471 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 OR5J2Q8NH18 312 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 OR52N1Q8NH53 320 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 HSD17B8Q92506 261 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PTP4A1Q93096 173 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SGTBQ96EQ0 304 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 RNFT2Q96EX2 444 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 DDOQ99489 341 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 MED18Q9BUE0 208 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 FKRPQ9H9S5 495 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PALMDQ9NP74 551 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ASB6Q9NWX5 421 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CCDC182A6NF36 153 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 A6NNC1 897 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ZNF726A6NNF4 738 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 IMPA2O14732 288 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 AIREO43918 545 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CTAG2O75638 210 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 NDUFB2O95178 105 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 TXNDC12O95881 172 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 IGHV3-9P01782 118 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PTNP21246 168 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 GALP22466 123 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 IGHV1-2P23083 117 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 IL32P24001 234 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 GADD45AP24522 165 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CDH11P55287 796 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 WNT4P56705 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CLDN17P56750 224 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PRPS1P60891 318 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 BDH1Q02338 343 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 PUDPQ08623 228 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 FAPQ12884 760 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 GGTLC2Q14390 218 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL28-204ENST00000514421 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.32□□□□□ -1.24
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