RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	RAB22A	Q9UL26	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GPR171	O14626	319 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC6	O43699	453 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MT-ATP6	P00846	226 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DRD3	P35462	400 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	HTR5A	P47898	357 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GABRE	P78334	506 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GPNMB	Q14956	572 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SPTBN2	O15020	2390 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		B8ZZF3	427 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		K7EPK0	472 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF44	P15621	663 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GDF1	P27539	372 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MVD	P53602	400 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SVBP	Q8N300	66 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PXT1	Q8NFP0	134 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		7.34	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PNR3	127 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IDS	B3KWA1	339 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01565	O15544	149 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NAGA	P17050	411 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PI3	P19957	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	P2RX1	P51575	399 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MAP2K6	P52564	334 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EFNA3	P52797	238 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R46	P59540	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ACSM1	Q08AH1	577 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TCTN1	Q2MV58	587 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR1S1	Q8NH92	325 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MED30	Q96HR3	178 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EMC3	Q9P0I2	261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GX78	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BET1	O15155	118 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LPL	P06858	475 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ATP1B3	P54709	279 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C21orf58	P58505	322 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00303	Q3SY05	128 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MISP	Q8IVT2	679 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MKX	Q8IYA7	352 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR2L13	Q8N349	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LILRB2	Q8N423	598 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD1	Q96SE0	405 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	HSPB6	O14558	160 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SNAPIN	O95295	136 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DDAH2	O95865	285 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CD27	P26842	260 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CSRP3	P50461	194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	AAED1	Q7RTV5	226 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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