RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 RNF13O43567 381 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TMPRSS11DO60235 418 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SLC19A2O60779 497 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 AQP8O94778 261 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TNFRSF1BP20333 461 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PRPS1L1P21108 318 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CD1CP29017 333 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MPGP29372 298 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CHRNA7P36544 502 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MAGEB1P43366 347 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MLF1P58340 268 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 FOXO1Q12778 655 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 NSDHLQ15738 373 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 UQCC3Q6UW78 93 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MS4A8Q9BY19 250 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 NBASA2RRP1 2371 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 C9J4A7 227 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PGRMC2O15173 223 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SUV39H1O43463 412 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PMP2P02689 132 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MAOAP21397 527 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 AKR1C3P42330 323 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PNLIPRP2P54317 469 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 RAG2P55895 527 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 RAP2BP61225 183 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 HES3Q5TGS1 186 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 FCRL6Q6DN72 434 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PRSS33Q8NF86 280 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OR10A4Q9H209 315 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 UPB1Q9UBR1 384 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM72A0PK05 275 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CDC14CA4D256 554 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 DVL2O14641 736 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TCF21O43680 179 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CLEC3AO75596 197 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 ACTL6AO96019 429 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 F10P00742 488 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CD2P06729 351 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 KDELR2P33947 212 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 DGCR2P98153 550 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 CDK6Q00534 326 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 NHLH2Q02577 135 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SHBQ15464 509 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 IDNKQ5T6J7 187 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 FDX2Q6P4F2 183 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SHISA5Q8N114 240 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PHYHIPQ92561 330 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 RAB3CQ96E17 227 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 IL17BQ9UHF5 180 aa6.57□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 APC2O95996 2303 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 NINQ8N4C6 2090 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 HMSDA8MTL9 139 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SLC25A12O75746 678 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OR2A4O95047 310 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OPN1SWP03999 348 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OPN1MWP04001 364 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ROBO1-211ENST00000498428 PAX6P26367 422 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms