RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	LAP3	P28838	519 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	IFNA8	P32881	189 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MPV17	P39210	176 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	PSG4	Q00888	419 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MVK	Q03426	396 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	PRKCD	Q05655	676 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FHL1	Q13642	323 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAM2	Q15035	370 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RBP7	Q96R05	134 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR160	Q9UJ42	338 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618		B4DSR2	109 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC22A2	O15244	555 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SCG5	P05408	212 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	THBS2	P35442	1172 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GSK3B	P49841	420 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TAF11	Q15544	211 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	IFI44L	Q53G44	452 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CBLL1	Q75N03	491 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	OAF	Q86UD1	273 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TREML1	Q86YW5	311 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CACNG2	Q9Y698	323 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A087WUU8	490 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CDC42EP2	O14613	210 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SPRY3	O43610	288 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GAA	P10253	952 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GCH1	P30793	250 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	NUDT2	P50583	147 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM33	P57088	247 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	LMO4	P61968	165 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM27B	Q5VT28	67 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	OTP	Q5XKR4	325 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF774	Q6NX45	483 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	USP51	Q70EK9	711 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD4	Q8TB40	342 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM162A	Q96A26	154 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	DYSF	O75923	2080 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ANK2	Q01484	3957 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618		A6NIZ1	184 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	PRSS23	O95084	383 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	NGF	P01138	241 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV1-46	P01743	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-13	P01766	116 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TF	P02787	698 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CST2	P09228	141 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	NR2C1	P13056	603 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC9A3	P48764	834 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF81	P51508	661 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RAP1B	P61224	184 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1CB	P62140	327 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RAP1A	P62834	184 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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