RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SGCZQ96LD1 299 aa11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PDE7BQ9NP56 450 aa11.26□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 FREM3P0C091 2139 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ADH1BP00325 375 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 DBHP09172 617 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ALOX5APP20292 161 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CPT2P23786 658 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP1B3P54709 279 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PMPCAQ10713 525 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4K15Q8NH41 348 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 MRGPRX3Q96LB0 322 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0A6YYD5 115 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 AIPO00170 330 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF264O43296 627 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CEACAM5P06731 702 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4E1P0C645 316 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 HRH1P35367 487 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SERPINF1P36955 418 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF85Q03923 595 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SGCBQ16585 318 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SP6Q3SY56 376 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CDONQ4KMG0 1287 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RAET1LQ5VY80 246 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 GABRG1Q8N1C3 465 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 STK35Q8TDR2 534 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM74A7A6NL05 159 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 AKR7A3O95154 331 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SEMA4FO95754 770 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CTSBP07858 339 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 VEGFBP49765 207 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TAS2R19P59542 299 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SRYQ05066 204 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF77Q15935 545 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM74A3Q4VXF1 159 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF611Q8N823 705 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.25□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PNR3 127 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAP1O75689 374 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 WDPCPO95876 746 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ACKR1Q16570 336 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC51BQ86UW2 128 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 UBALD1Q8TB05 177 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 MED17Q9NVC6 651 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 CXCL2P19875 107 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 FUT5Q11128 374 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM53BQ14153 422 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM65Q6PI78 240 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.24□□□□□ -0.61
TRIOBP-211ENST00000492485 OR1J4Q8NGS1 313 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms