RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490332.2

PTPRK-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-213	ENST00000490332	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	NSMAF	Q92636	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	MED30	Q96HR3	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	MED28	Q9H204	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	WDR76	Q9H967	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332		V9GY05	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332		A0A1W2PRG6	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332		A6NIZ1	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332		A8MVM7	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	AIP	O00170	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	XKRY	O14609	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	NDUFB5	O43674	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	DUX1	O43812	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SSX4	O60224	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SLC25A12	O75746	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	NCR1	O76036	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	OR6A2	O95222	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TF	P02787	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	IGKV3-11	P04433	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TCRB	P04435	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	JMJD7	P0C870	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	COX6B1	P14854	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ARSB	P15848	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	PRKCA	P17252	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	MAOA	P21397	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	STOM	P27105	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TACR3	P29371	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	IL12B	P29460	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	UQCRC1	P31930	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	AQP2	P41181	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	P2RX1	P51575	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	CCR9	P51686	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	RAP1B	P61224	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	PPP1CA	P62136	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	RAP1A	P62834	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	IFITM2	Q01629	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SKP2	Q13309	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	CBFB	Q13951	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	TOMM20	Q15388	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-213	ENST00000490332	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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