RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 PLP2Q04941 152 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 BNIP1Q12981 228 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 SYT9Q86SS6 491 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 ADCK1Q86TW2 530 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 OR2T29Q8NH02 315 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 LRGUKQ96M69 825 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 SMR3AQ99954 134 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 WACQ9BTA9 647 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 POLE4Q9NR33 117 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 GPRIN2O60269 458 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 CTLA4P16410 223 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 MSR1P21757 451 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 PCSK6P29122 969 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 PPOXP50336 477 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 NUDT6P53370 316 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 DSCR9P59020 149 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 GALK2Q01415 458 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 FANK1Q8TC84 345 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 VNN3Q9NY84 501 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-209ENST00000485765 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SOCS2O14508 198 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 IDH3BO43837 385 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 STAMBPO95630 424 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R3DO95685 299 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 GASTP01350 101 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 CCL2P13500 99 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SLC6A6P31641 620 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 PCBD1P61457 104 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 HSF2Q03933 536 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 GK3PQ14409 553 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SAMD8Q96LT4 415 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SNX18Q96RF0 628 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 CHID1Q9BWS9 393 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 REG4Q9BYZ8 158 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SYT4Q9H2B2 425 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PPL8 197 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 GSC2O15499 205 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SLC16A7O60669 478 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 CCNB2O95067 398 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 STOMP27105 288 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 UCP2P55851 309 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 KCNMB1Q16558 191 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 MICAQ29983 383 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SVOPLQ8N434 492 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 NUAK2Q9H093 628 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 CDH20Q9HBT6 801 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 IL20Q9NYY1 176 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 RTTNQ86VV8 2226 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 RNF223E7ERA6 249 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 LY6G6DO95868 133 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 APLNRP35414 380 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 AKR7LQ8NHP1 331 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 IFT27Q9BW83 186 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-209ENST00000485765 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms