RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 FKRPQ9H9S5 495 aa6.81□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.81□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 MOKQ9UQ07 419 aa6.81□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 A0A0G2JMP0 313 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM233B4DJY2 109 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 J3QLI3 93 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 ARPC2O15144 300 aa6.8□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 TFP02787 698 aa6.8□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.328e-10■■■■□ 24.9
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SZRD1-208ENST00000476423 CCR4P51679 360 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 SSTP61278 116 aa6.8□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 IMPG1Q17R60 797 aa6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.8□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.8□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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SZRD1-208ENST00000476423 ADRA2CP18825 462 aa6.79□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 SKP2Q13309 424 aa6.79□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 MAB21L1Q13394 359 aa6.79□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 QPRTQ15274 297 aa6.79□□□□□ -1.32
SZRD1-208ENST00000476423 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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