RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	MOK	Q9UQ07	419 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP7	Q9Y680	259 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	VSTM5	A8MXK1	200 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241		E7EQL1	145 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SNAP29	O95721	258 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	IFNG	P01579	166 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF35	P13682	527 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	OSM	P13725	252 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CDA	P32320	146 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	TTK	P33981	857 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	GLO1	Q04760	184 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	PIGF	Q07326	219 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	TESK1	Q15569	626 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SGCA	Q16586	387 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	PGGHG	Q32M88	737 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	FAHD1	Q6P587	224 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	LEG1	Q6P5S2	330 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	OR4K13	Q8NH42	304 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	NMNAT3	Q96T66	252 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	GSX2	Q9BZM3	304 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	NUAK2	Q9H093	628 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	RNF121	Q9H920	327 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	NOX3	Q9HBY0	568 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	USF3	Q68DE3	2245 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPL8	197 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	OVOL3	O00110	214 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SMPD2	O60906	423 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CELA3B	P08861	270 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	COX5B	P10606	129 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	BMP4	P12644	408 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	NR4A1	P22736	598 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	PCSK6	P29122	969 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CALCR	P30988	508 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	GRK5	P34947	590 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CENPA	P49450	140 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ERF	P50548	548 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	HSF2	Q03933	536 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	AQP6	Q13520	282 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	RAB39A	Q14964	217 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	MUC15	Q8N387	334 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T4	Q8NH00	348 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	NEUROG1	Q92886	237 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	DDO	Q99489	341 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CMC2	Q9NRP2	79 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CA10	Q9NS85	328 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	B9D1	Q9UPM9	204 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241		G3V2T6	193 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241		H3BN98	237 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SOX14	O95416	240 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	HMGN1	P05114	100 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	SOD3	P08294	240 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF3	P17036	446 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PTPA-222	ENST00000445241	FABP6	P51161	128 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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