RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 PLP2Q04941 152 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNIQ14094 377 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 LNX2Q8N448 690 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 HTRA1Q92743 480 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO17Q96EF6 278 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NUAK2Q9H093 628 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NTN4Q9HB63 628 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 AP4S1Q9Y587 144 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPL8 197 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA8P13928 327 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NR4A1P22736 598 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PTH2RP49190 550 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNMB1Q16558 191 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4K13Q8NH42 304 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NMNAT3Q96T66 252 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DDOQ99489 341 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 B9D1Q9UPM9 204 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBP7Q9Y680 259 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TIPRLO75663 272 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SCG5P05408 212 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 FCGR1AP12314 374 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 BMP4P12644 408 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF32P17041 273 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINF1P36955 418 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 PSG4Q00888 419 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 DAG1Q14118 895 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 EFNB3Q15768 340 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6AP1Q15904 470 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 MST1LQ2TV78 715 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 LEG1Q6P5S2 330 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6V1Q8N148 313 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2T33Q8NG76 320 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 BDH2Q9BUT1 245 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6C68A6NDL8 312 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SNAP29O95721 258 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 FASP25445 335 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 THBS4P35443 961 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 GLRXP35754 106 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAM8P78325 824 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 HSF2Q03933 536 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ADIPOQQ15848 244 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCE1Q9P212 2302 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 B9A039 149 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 DCTN6O00399 190 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SOX14O95416 240 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4A8P0C604 315 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 OSMP13725 252 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-204ENST00000442563 PRKACGP22612 351 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms