RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 APLNRP35414 380 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 WNT5AP41221 380 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MAGEB1P43366 347 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 OMPP47874 163 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LIMS1P48059 325 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FXYD6P3P58550 94 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PSG4Q00888 419 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PLP2Q04941 152 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZBED5Q49AG3 693 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CYB5R2Q6BCY4 276 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PGAM4Q8N0Y7 254 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF570Q96NI8 536 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RBP7Q96R05 134 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SNX18Q96RF0 628 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CDRT15Q96T59 188 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GPA33Q99795 319 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 KCNN2Q9H2S1 579 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PRQ8 180 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 A6NIZ1 184 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SOCS2O14508 198 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LILRA1O75019 489 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SNAP29O95721 258 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SEMG1P04279 462 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CD14P08571 375 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 HSD17B1P14061 328 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF23P17027 643 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RHCEP18577 417 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 COL8A2P25067 703 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 STOMP27105 288 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 EVX1P49640 407 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 UCP2P55851 309 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RAP1BP61224 184 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RAP1AP62834 184 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MXRA7P84157 204 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SPIBQ01892 262 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CCNIQ14094 377 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DGCR6Q14129 220 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 THEM4Q5T1C6 240 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FAM27BQ5VT28 67 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF774Q6NX45 483 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FAM122BQ7Z309 247 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DPPA2Q7Z7J5 298 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF786Q8N393 782 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 POM121L2Q96KW2 1035 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 C1orf198Q9H425 327 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RERGLQ9H628 205 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CD300AQ9UGN4 299 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 C5orf49A4QMS7 147 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PTP4A3O75365 173 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GMNNO75496 209 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NDUFB2O95178 105 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GPANK1O95872 356 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PTHP01270 115 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NR2C1P13056 603 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CTLA4P16410 223 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GIFP27352 417 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MPV17P39210 176 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GZMKP49863 264 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RIN1Q13671 783 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 YIPF5Q969M3 257 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PYURFQ96I23 114 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms