RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 CST2P09228 141 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CLUP10909 449 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF32P17041 273 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NPR2P20594 1047 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NR4A1P22736 598 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 APEX1P27695 318 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 EPHA2P29317 976 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NOS3P29474 1203 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC6A6P31641 620 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PYCR1P32322 319 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GGT2P36268 569 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ARR3P36575 388 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 WNT5AP41221 380 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RPS27P42677 84 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CAPZA2P47755 286 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FABP6P51161 128 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RAP1BP61224 184 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ERVS71-1P61550 626 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RAP1AP62834 184 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 HIST1H3AP68431 136 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KCNMB1Q16558 191 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SGCAQ16586 387 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MEP1BQ16820 701 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GSG1Q2KHT4 349 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NRN1LQ496H8 165 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 Q5PR19 223 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FAM27BQ5VT28 67 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GPR139Q6DWJ6 353 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KRT80Q6KB66 452 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ACSM5Q6NUN0 579 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF774Q6NX45 483 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FAHD1Q6P587 224 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LEG1Q6P5S2 330 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CORO6Q6QEF8 472 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 VHLLQ6RSH7 139 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CD300LDQ6UXZ3 194 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 HIST2H3AQ71DI3 136 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SSX8Q7RTT4 187 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC16A14Q7RTX9 510 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 AMIGO2Q86SJ2 522 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZBTB46Q86UZ6 589 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MUC15Q8N387 334 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LNX2Q8N448 690 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CYB561A3Q8NBI2 242 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SDR9C7Q8NEX9 313 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NUP37Q8NFH4 326 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OR52E2Q8NGJ4 325 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FANK1Q8TC84 345 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GIPC3Q8TF64 312 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LRTOMTQ8WZ04 291 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC7A6Q92536 515 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PTP4A1Q93096 173 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PIGTQ969N2 578 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PERPQ96FX8 193 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RADILQ96JH8 1075 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 POM121L2Q96KW2 1035 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LRGUKQ96M69 825 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DOK1Q99704 481 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CCL19Q99731 98 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 IFT27Q9BW83 186 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF416Q9BWM5 594 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TSSK6Q9BXA6 273 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GRIP2Q9C0E4 1043 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PLK3Q9H4B4 646 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 REEP1Q9H902 201 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SIAEQ9HAT2 523 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CA10Q9NS85 328 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms