RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 LDAHQ9H6V9 325 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 PROK2Q9HC23 129 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 LRP12Q9Y561 859 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ACACAQ13085 2346 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GTF3C1Q12789 2109 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 MYO7BQ6PIF6 2116 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 PINLYPA6NC86 204 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ACOD1A6NK06 481 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 E9PI62 339 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 HAX1O00165 279 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GPR171O14626 319 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 OGG1O15527 345 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GFRA3O60609 400 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 WISP1O95388 367 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GPANK1O95872 356 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ACTL6AO96019 429 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 APOC1P02654 83 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ALOX5APP20292 161 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ACHEP22303 614 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CD97P48960 835 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 P2RY4P51582 365 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CLDN20P56880 219 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CARD18P57730 90 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CLN3Q13286 438 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 DOC2BQ14184 412 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF181Q2M3W8 571 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRIM16LQ309B1 348 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 WDR38Q5JTN6 314 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CEP78Q5JTW2 689 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 IDNKQ5T6J7 187 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 LIPNQ5VXI9 398 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRIQKQ629K1 86 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 SFXN4Q6P4A7 337 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 FCRLAQ7L513 359 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ASCL5Q7RTU5 278 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 AAED1Q7RTV5 226 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 LUZP2Q86TE4 346 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GGNQ86UU5 652 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 SULF2Q8IWU5 870 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 LAX1Q8IWV1 398 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GHSRQ92847 366 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLAMF6Q96DU3 332 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 DIRAS2Q96HU8 199 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 TXNDC15Q96J42 360 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 C4orf45Q96LM5 186 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 WDFY2Q96P53 400 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ABHD6Q9BV23 337 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC32Q9BV29 185 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 HES7Q9BYE0 225 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 SRXN1Q9BYN0 137 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 NIPAL2Q9H841 368 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CENPMQ9NSP4 180 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 DEPPQ9NTK1 212 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 GLTPQ9NZD2 209 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 DHDHQ9UQ10 334 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 R4GMQ9 66 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 URB1O60287 2271 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.6-201ENST00000384569 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms