RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 RERGLQ9H628 205 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 MED20Q9H944 212 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 SLC16A7O60669 478 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 SEC14L2O76054 403 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 CTLA4P16410 223 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 CEACAM16Q2WEN9 425 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35D3Q5M8T2 416 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf135Q5VTT2 229 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 XKRXQ6PP77 449 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 NSMAFQ92636 917 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 TEAD3Q99594 435 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 JAM3Q9BX67 310 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHS1-201ENST00000368547 FLNCQ14315 2725 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 DCTN6O00399 190 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 AGAP20933 346 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 MAP2K4P45985 399 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 OR6V1Q8N148 313 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 OR13F1Q8NGS4 319 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 TMIGD2Q96BF3 282 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC182A6NF36 153 aa26■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 DHHO43323 396 aa26■■□□□ 1.75
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ECHS1-201ENST00000368547 ETFDHQ16134 617 aa26■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 C10orf128Q5T292 105 aa26■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 NKX2-6A6NCS4 301 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 AGFG2O95081 481 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA5P08648 1049 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 MPGP29372 298 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ASCL1P50553 236 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 POU4F2Q12837 409 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 FOXB2Q5VYV0 432 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 OR51V1Q9H2C8 321 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 B9D1Q9UPM9 204 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 GYPBP06028 91 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ADRA2AP08913 450 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CLUP10909 449 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CRABP1P29762 137 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL12Q53G59 568 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 LCN1P1Q5VSP4 162 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ERGIC3Q9Y282 383 aa25.99■■□□□ 1.75
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ECHS1-201ENST00000368547 J3QRE1 110 aa25.98■■□□□ 1.75
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ECHS1-201ENST00000368547 COX5AP20674 150 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
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ECHS1-201ENST00000368547 P2RY6Q15077 328 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 DNM1P34Q6PK57 102 aa25.98■■□□□ 1.75
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ECHS1-201ENST00000368547 OR2T4Q8NH00 348 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ16Q9NPI9 418 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT8Q9NY28 637 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R16Q9NYV7 291 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 MOKQ9UQ07 419 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 LYZL6O75951 148 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 INMTO95050 263 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 SPI1P17947 270 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 MYL12AP19105 171 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF84P51523 738 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 PROKR2Q8NFJ6 384 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 OR51L1Q8NGJ5 315 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 FOXN4Q96NZ1 517 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 MND1Q9BWT6 205 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 RACGAP1Q9H0H5 632 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ELOVL5Q9NYP7 299 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 FAM171A2A8MVW0 826 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN14O95500 239 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 GSTT1P30711 240 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 PYCR1P32322 319 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 GP2P55259 537 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 RPS7P62081 194 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ARF1P84077 181 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 TSC22D1Q15714 1073 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF367Q7RTV3 350 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNRF4Q8WWF5 429 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CEPT1Q9Y6K0 416 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 PTHP01270 115 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHS1-201ENST00000368547 CDAP32320 146 aa25.96■■□□□ 1.75
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