RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 CHRNB3Q05901 458 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SPOCK1Q08629 439 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SKP2Q13309 424 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 VWA2Q5GFL6 755 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 TMEM107Q6UX40 140 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 CASP12Q6UXS9 341 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PXKQ7Z7A4 578 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 CMBLQ96DG6 245 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SAMD8Q96LT4 415 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 STACQ99469 402 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ALG8Q9BVK2 526 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PKIBQ9C010 78 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 CACNA1AO00555 2505 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 A0A1W2PRV1 198 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 C1orf226A1L170 272 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 OR6C68A6NDL8 312 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FAM227AF5H4B4 570 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LPLP06858 475 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PPP3CBP16298 524 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 IFNGR2P38484 337 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SMSP52788 366 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 DIO3P55073 304 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ERVS71-1P61550 626 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SELENOTP62341 195 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PPP3R1P63098 170 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SSX7Q7RTT5 188 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SHISA5Q8N114 240 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 COMMD1Q8N668 190 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FBXL20Q96IG2 436 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SPSB2Q99619 263 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LANCL2Q9NS86 450 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 DECR2Q9NUI1 292 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 AIFM1O95831 613 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 HLA-DQB1P01920 261 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 MT-ND4LP03901 98 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 IL3P08700 152 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 NR2F6P10588 404 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FGF7P21781 194 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ABCD3P28288 659 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 DLSTP36957 453 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 C2orf80Q0P641 193 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SLC17A1Q14916 467 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 TGIF1Q15583 401 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ZNF573Q86YE8 665 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 C1QL4Q86Z23 238 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 RASD2Q96D21 266 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 TSSK3Q96PN8 268 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 JAM3Q9BX67 310 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 MMP28Q9H239 520 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 FKRPQ9H9S5 495 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 ABCB9Q9NP78 766 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 AIG1Q9NVV5 245 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-201ENST00000351328 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms