RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 FAM27BQ5VT28 67 aa24.36■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf40Q8WZ69 217 aa24.36■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 HAO2Q9NYQ3 351 aa24.36■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC42Q9Y546 428 aa24.36■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 A0A096LPE4 126 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PPZ6 126 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 WIPF3A6NGB9 483 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF823P16415 610 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 UGT2B10P36537 528 aa24.35■■□□□ 1.49
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GIPC1-201ENST00000345425 MED21Q13503 144 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 TSC22D1Q15714 1073 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC36Q8IYA8 594 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF511Q8NB15 262 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 OR10A4Q9H209 315 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 KCNN2Q9H2S1 579 aa24.35■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa24.35■■□□□ 1.49
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GIPC1-201ENST00000345425 MPZL1O95297 269 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 TFP02787 698 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 POU4F2Q12837 409 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 GGTLC2Q14390 218 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 TBRG1Q3YBR2 411 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 HTRA1Q92743 480 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 MARCH7Q9H992 704 aa24.34■■□□□ 1.49
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GIPC1-201ENST00000345425 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
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GIPC1-201ENST00000345425 LYPD4Q6UWN0 246 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 B3GLCTQ6Y288 498 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC18Q8N456 261 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 INTS14Q96SY0 518 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 POLR1DQ9Y2S0 133 aa24.34■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 SCG5P05408 212 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 NUDT6P53370 316 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM8P78325 824 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 MEP1BQ16820 701 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 HIKESHIQ53FT3 197 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 SLC16A14Q7RTX9 510 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 P2RY8Q86VZ1 359 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 SH3GL3Q99963 347 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR6Q9GZN1 396 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 EMC7Q9NPA0 242 aa24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-201ENST00000345425 CST2P09228 141 aa24.32■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 ENTPD1P49961 510 aa24.32■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
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GIPC1-201ENST00000345425 DPPA2Q7Z7J5 298 aa24.32■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SKA3Q8IX90 412 aa24.32■■□□□ 1.48
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GIPC1-201ENST00000345425 CDADC1Q9BWV3 514 aa24.32■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 OBP2BQ9NPH6 170 aa24.32■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SLC17A5Q9NRA2 495 aa24.32■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 OR5H1A6NKK0 313 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 TMCC2O75069 709 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 DBTP11182 482 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 CCKARP32238 428 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V1E1P36543 226 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SORDQ00796 357 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SLC36A2Q495M3 483 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 TIMM23BQ5SRD1 257 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 C6orf141Q5SZD1 244 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 TIGD4Q8IY51 512 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 S100PBPQ96BU1 408 aa24.31■■□□□ 1.48
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GIPC1-201ENST00000345425 CSNK2BP67870 215 aa24.31■■□□□ 1.48
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GIPC1-201ENST00000345425 AMDHD2Q9Y303 409 aa24.31■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 PPP3CBP16298 524 aa24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 AQP6Q13520 282 aa24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 TEX30Q5JUR7 227 aa24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 LAIR2Q6ISS4 152 aa24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SYT9Q86SS6 491 aa24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GIPC1-201ENST00000345425 SELENOFO60613 162 aa24.29■■□□□ 1.48
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