RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 RDH8Q9NYR8 311 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 LRRN3E7EW58 273 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 G3V3Y1 287 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ARPC5O15511 151 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PRKYO43930 277 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 FAM20BO75063 409 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 GAAP10253 952 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CASRP41180 1078 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CDH15P55291 814 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CXCR4P61073 352 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OXA1LQ15070 435 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PLA1AQ53H76 456 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 COMMD7Q86VX2 200 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OR2T33Q8NG76 320 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OR51A7Q8NH64 312 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 LIPHQ8WWY8 451 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 MED18Q9BUE0 208 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CLN6Q9NWW5 311 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JMM0 328 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPB8 328 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PRS3 328 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 A8MVM7 634 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 AHRRA9YTQ3 701 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CLDN25C9JDP6 229 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 BHLHE40O14503 412 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 RGS10O43665 173 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 XPNPEP2O43895 674 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 F10P00742 488 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 BGLAPP02818 100 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PRF1P14222 555 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 RAB3BP20337 219 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CTSSP25774 331 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 GRK5P34947 590 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CD96P40200 585 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 EFNB1P98172 346 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 BDH1Q02338 343 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 LTBQ06643 244 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SCGB2A2Q13296 93 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SNAPC1Q16533 368 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 STK35Q8TDR2 534 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WZY1 265 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SURF4O15260 269 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ATG12O94817 140 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 WDPCPO95876 746 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 STAG3L2P0CL84 134 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 BMP7P18075 431 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SPINK2P20155 84 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 CNR1P21554 472 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 MLLT10P55197 1068 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SOX8P57073 446 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 TMEM163Q8TC26 289 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 DDIT4LQ96D03 193 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SOX7Q9BT81 388 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 UBQLN3Q9H347 655 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-201ENST00000341935 SCN3BQ9NY72 215 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms