RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 STAG3L3P0CL85 134 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 XKR7Q5GH72 579 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 A0A087X0M5 115 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 A0A1B0GV72 72 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 A0A1B0GX30 115 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ANTXRLA6NF34 631 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 A6NJY4 79 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ACVRL1P37023 503 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BOD1Q96IK1 185 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 C17orf105B2RV13 164 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC31A1O15431 190 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NAT2P11245 290 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GDI1P31150 447 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 KIR2DL3P43628 341 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 XCR1P46094 333 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GPM6AP51674 278 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NECTIN4Q96NY8 510 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MBTPS2O43462 519 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MTX2O75431 263 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR4E1P0C645 316 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GPX2P18283 190 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CD80P33681 288 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RAB38P57729 211 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MMP21Q8N119 569 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 C2orf50Q96LR7 162 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MS4A10Q96PG2 267 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DUSP21Q9H596 190 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 F2P00734 622 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MSX1P28360 303 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CSF2RBP32927 897 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ERVS71-1P61550 626 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 IKZF1Q13422 519 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TRNP1Q6NT89 227 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ERASQ7Z444 233 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ASB11Q8WXH4 323 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 EPXP11678 715 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FOLR3P41439 243 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 F2RL3Q96RI0 385 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR6C76A6NM76 312 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 A8MU76 341 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PDE6DO43924 150 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF217O75362 1048 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC6A11P48066 632 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 WNT7BP56706 349 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 KRTDAPP60985 99 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SHC2P98077 582 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NGBQ9NPG2 151 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FAM74A7A6NL05 159 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 WNT11O96014 354 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CBR1P16152 277 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FCGR2CP31995 323 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms