RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 OR6X1Q8NH79 312 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 RNF128Q8TEB7 428 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HTRA1Q92743 480 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 C4orf45Q96LM5 186 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 UCN2Q96RP3 112 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GFI1Q99684 422 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 A0A0B4J203 849 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FUOMA2VDF0 154 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 IL7P13232 177 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ATF1P18846 271 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CLDN17P56750 224 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 TEX30Q5JUR7 227 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 LAP3P28838 519 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TGIF1Q15583 401 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 DTX3Q8N9I9 347 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ST7LQ8TDW4 575 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SP140LQ9H930 580 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.92■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 BCAP31P51572 246 aa15.92■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 DEFA3P59666 94 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 IL18Q14116 193 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 MFRPQ9BY79 579 aa15.92■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.92■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQ09 198 aa15.91■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 TAB1Q15750 504 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 MCHR2Q969V1 340 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HES7Q9BYE0 225 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM117AQ9C073 453 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GVC2 190 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 A6NIN4 97 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SSX4O60224 188 aa15.9■□□□□ 0.14
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