RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTLA4P16410 223 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSSP48637 474 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSCR9P59020 149 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSF2Q03933 536 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP1-1Q07627 177 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT4Q9H2B2 425 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52D1Q9H346 318 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH20Q9HBT6 801 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLE4Q9NR33 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP7Q9Y680 259 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOCS2O14508 198 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMPA2O14732 288 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA1O95477 2261 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R3DO95685 299 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTHP01270 115 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCG5P05408 212 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM157BP0CG42 384 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSR1P21757 451 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIVEP2P31629 2446 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGA2P52926 109 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSG4Q00888 419 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLP2Q04941 152 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf94Q6P1W5 598 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCK1Q86TW2 530 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 THTPAQ9BU02 230 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF11BO00300 401 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOT8O14734 319 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT36O76013 467 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF3P09919 207 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 APEHP13798 732 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNGR2P38484 337 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS6KA3P51812 740 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFX4Q33E94 735 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR7LQ8NHP1 331 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM168AQ92567 244 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT3Q9BQG1 590 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD10Q9BSF8 475 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51B6Q9H340 312 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMC7Q9NPA0 242 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 VNN3Q9NY84 501 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FZR1Q9UM11 496 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A6P31641 620 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 APLNRP35414 380 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 EVX1P49640 407 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN31Q12999 210 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP11Q86VZ4 500 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM15Q9C019 465 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB1BQ9H0U4 201 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A7O60669 478 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 STOMP27105 288 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCSK6P29122 969 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVS71-1P61550 626 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF774Q6NX45 483 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD8Q96LT4 415 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRGUKQ96M69 825 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms