RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CTSFQ9UBX1 484 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 YKT6O15498 198 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DOK2O60496 412 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 IL11P20809 199 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NXPH1P58417 271 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 BAMBIQ13145 260 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MELKQ14680 651 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 BIVMQ86UB2 503 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CHIAQ9BZP6 476 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RAB33BQ9H082 229 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NOX3Q9HBY0 568 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS37A4D1T9 235 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM212A6NML5 194 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 G3V3Q6 166 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SSX5O60225 188 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MPZL1O95297 269 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SPARCP09486 303 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CTLA4P16410 223 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PGCP20142 388 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DNASE1P24855 282 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CCKBRP32239 447 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CBFBQ13951 182 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CLLU1Q5K131 121 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PIAS2O75928 621 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 HLA-DOBP13765 273 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MCHR2Q969V1 340 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RAB19A4D1S5 217 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MPC2O95563 127 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 IFNA7P01567 189 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ALDOBP05062 364 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC17A1Q14916 467 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SGCBQ16585 318 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 HGDQ93099 445 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MVB12AQ96EY5 273 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR8B4Q96RC9 309 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GTQ1 180 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SULT1B1O43704 296 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TPOP07202 933 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ITGA5P08648 1049 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZP3P21754 424 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DCAF7P61962 342 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GUCA2AQ02747 115 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF519Q8TB69 540 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PPL8 197 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ACOT7O00154 380 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MBTPS2O43462 519 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NPIPB7O75200 414 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 KDM4BO94953 1096 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR6A2O95222 327 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 AP3S2P59780 193 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TDGQ13569 410 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms