RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC18B1Q6NT16 456 aa18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 RPTNQ6XPR3 784 aa18.3■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 SYS1Q8N2H4 156 aa18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.3■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 POLR1DQ9Y2S0 133 aa18.3■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 H3BSA7 217 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 J3QLW9 94 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV3-9P01782 118 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 PSKH1P11801 424 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF19P17023 458 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MSR1P21757 451 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 OR12D2P58182 307 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNMB1Q16558 191 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR107Q5VW38 600 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 GFRALQ6UXV0 394 aa18.29■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 GCNT2Q8N0V5 402 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf106Q8NAJ2 232 aa18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 EDNRAP25101 427 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 EGR3Q06889 387 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ACSM1Q08AH1 577 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf185Q5T7R7 199 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXB2Q5VYV0 432 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACSIN3-201ENST00000298838 BABAM2Q9NXR7 383 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 GNG8Q9UK08 70 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 EMC9Q9Y3B6 208 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL8A6PVC2 850 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS6P49758 472 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 BDH1Q02338 343 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 SGCAQ16586 387 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 LINGO2Q7L985 606 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM220AQ7Z4H9 259 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00346Q8IVM7 164 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FUNDC2Q9BWH2 189 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf49Q9H741 205 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 UPB1Q9UBR1 384 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 IKZF2Q9UKS7 526 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR32B1ATL7 298 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CCRL2O00421 344 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 PRRG2O14669 202 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT8P05787 483 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CD36P16671 472 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 NPR2P20594 1047 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 LSM6P62312 80 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 LY6DQ14210 128 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 GUSBP1Q15486 140 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 STK11Q15831 433 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF684Q5T5D7 378 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
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