RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PSMB5P28074 263 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TEKQ02763 1124 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZFP90Q8TF47 636 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CMTM3Q96MX0 182 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR51I2Q9H344 312 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GWA3 101 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ARPC3O15145 178 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 VEGFBP49765 207 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MYBPHQ13203 477 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 REEP6Q96HR9 211 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 LGI1O95970 557 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 H0YIV9 168 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ADRA1AP35348 466 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 POU4F3Q15319 338 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR2A14Q96R47 310 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TGM4P49221 684 aa8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FAM189BP81408 668 aa8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 YIPF5Q969M3 257 aa8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GLAP06280 429 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 HS3ST1O14792 307 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GNB1P62873 340 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SARAFQ96BY9 339 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 DUSP13Q9UII6 198 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 A0A0B4J2A0 478 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GYPBP06028 91 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SHHQ15465 462 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MED25Q71SY5 747 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ACHEP22303 614 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OPCMLQ14982 345 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GPR26Q8NDV2 337 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 RAB27BO00194 218 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 LIPCP11150 499 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 LIPHQ8WWY8 451 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OR6C76A6NM76 312 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SSSCA1O60232 199 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FURINP09958 794 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 USP51Q70EK9 711 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 LSMEM2Q8N112 164 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FAM183AA6NL82 134 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SCD5Q86SK9 330 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SLC51BQ86UW2 128 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 KPTNQ9Y664 436 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 H7C1C5 153 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OR52N1Q8NH53 320 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NMNAT3Q96T66 252 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MED20Q9H944 212 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FGF21Q9NSA1 209 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ACOD1A6NK06 481 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 HSD17B6O14756 317 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SGCEO43556 437 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NPY4RP50391 375 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OBP2AQ9NY56 170 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ATP1B1P05026 303 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CD27P26842 260 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 DOC2BQ14184 412 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SPRED1Q7Z699 444 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms