RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292408.8

FGFR4-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-201ENST00000292408 GPR31O00270 319 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 PRPS1P60891 318 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 BIKQ13323 160 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 IL10RAQ13651 578 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 Q6ZSR6 202 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 INTS14Q96SY0 518 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 MMP25Q9NPA2 562 aa14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
FGFR4-201ENST00000292408 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OR5H14A6NHG9 310 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 HCRTR2O43614 444 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ALOX5APP20292 161 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 CAPZA1P52907 286 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 IKZF1Q13422 519 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 CSF1P09603 554 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 SDHAP31040 664 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ATP1B3P54709 279 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 RAB38P57729 211 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 DHODHQ02127 395 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 GPM6BQ13491 265 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 FAM122BQ7Z309 247 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OOSP2Q86WS3 158 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OR13H1Q8NG92 308 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.83□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 C2orf72A6NCS6 295 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 EPHA4P54764 986 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 SPACA5Q96QH8 159 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 EDARQ9UNE0 448 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 PRAMEF2O60811 474 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 AKR1C4P17516 323 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 CDNFQ49AH0 187 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 CDC20BQ86Y33 519 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 C4orf45Q96LM5 186 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 LDAHQ9H6V9 325 aa14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 TNFSF14O43557 240 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 HPP00738 406 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 RD3LP0DJH9 198 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 MPGP29372 298 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 NTSR1P30989 418 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 DHRS2Q13268 280 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 TMEM240Q5SV17 173 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 NPAS1Q99742 590 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 SLC6A7Q99884 636 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 MSRAQ9UJ68 235 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 PTPRSQ13332 1948 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 A0A0J9YY10 115 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 HMSDA8MTL9 139 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 XKRYO14609 159 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.047e-7■□□□□ 11.2
FGFR4-201ENST00000292408 RENP00797 406 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 DEFB119Q8N690 84 aa14.81□□□□□ -0.04
FGFR4-201ENST00000292408 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms