RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TSSK2Q96PF2 358 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PLXNB2O15031 1838 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SGCEO43556 437 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 DOK2O60496 412 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PPP3CBP16298 524 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SPI1P17947 270 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PNLIPRP2P54317 469 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TAS2R30P59541 319 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 BTG2P78543 158 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CAMK2BQ13554 666 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 KCNJ8Q15842 424 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 USP51Q70EK9 711 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 IFI44Q8TCB0 444 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 FOXQ1Q9C009 403 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 LTBP1Q14766 1721 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PCM1Q15154 2024 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 VHLLQ6RSH7 139 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF547Q8IVP9 402 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM99Q8N816 258 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 OR4N2Q8NGD1 307 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 EMC6Q9BV81 110 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 POMT2Q9UKY4 750 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 LILRA5A6NI73 299 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 A8MXE2 369 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 LMO7DNF2Z398 122 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 H7C1Q1 480 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 NXPH2O95156 264 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 FUCA1P04066 466 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF728P0DKX0 622 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CALCBP10092 127 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ECI1P42126 302 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 RUNX2Q13950 521 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 OPCMLQ14982 345 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 NAXDQ8IW45 347 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 POC1BQ8TC44 478 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TSLPQ969D9 159 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PIGTQ969N2 578 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ABHD6Q9BV23 337 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 AQP6Q13520 282 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 MALSU1Q96EH3 234 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SDSLQ96GA7 329 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TPOP07202 933 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SLC2A1P11166 492 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 BEX5Q5H9J7 111 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SEC22AQ96IW7 307 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 AGAP14A8MT82 685 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 METTL12A8MUP2 240 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SHOXO15266 292 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 FBXO24O75426 580 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PMS2P2O95744 297 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CHRNB4P30926 498 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SNCAP37840 140 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CCL11P51671 97 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 BDH1Q02338 343 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 GHRLQ9UBU3 117 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 TET1Q8NFU7 2136 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 GABARAPH6UMI1 98 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 CPEP16870 476 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 RAB6AP20340 208 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PLA2G7Q13093 441 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 FCN2Q15485 313 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms