RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM106AQ96A25 262 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 MMP28Q9H239 520 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 LRP12Q9Y561 859 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1B0GTH9 108 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 AQP7P3A6NL99 342 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 IGHG1P01857 330 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CCL3P10147 92 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF17P17021 662 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 FMODQ06828 376 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 OR6X1Q8NH79 312 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ST7LQ8TDW4 575 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SPRY4Q9C004 299 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ABCG5Q9H222 651 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 PROK2Q9HC23 129 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 R4GMQ9 66 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SOX2P48431 317 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 RELTQ969Z4 430 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 A0A087WV48 116 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0B4J203 849 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 NR2C1P13056 603 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CD59P13987 128 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 DCTDP32321 178 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEB1P43366 347 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN20P56880 219 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CARTPTQ16568 116 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 HES5Q5TA89 166 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CT55Q8WUE5 264 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ORAI1Q96D31 301 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 LIN7BQ9HAP6 207 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 HMX3A6NHT5 357 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SULT1B1O43704 296 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CCNKO75909 580 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 PGA4P0DJD7 388 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 PGA3P0DJD8 388 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ADRA2CP18825 462 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TCN2P20062 427 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TIGD3Q6B0B8 471 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 OR7E24Q6IFN5 339 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 FAM117AQ9C073 453 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PNR3 127 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SULT2B1O00204 365 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CBR3O75828 277 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 MPZL1O95297 269 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 PNPP00491 289 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ISG15P05161 165 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 JMJD7P0C870 316 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 HLA-DMAP28067 261 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 LAP3P28838 519 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 MNDAP41218 407 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CLRN1P58418 232 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 NHLH1Q02575 133 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CBX3Q13185 183 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM225Q6GV28 225 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 NAXDQ8IW45 347 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 CMTM4Q8IZR5 234 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 YIPF5Q969M3 257 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 FOXJ3Q9UPW0 622 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF43P17038 809 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A1P30531 599 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HOXD9-201ENST00000249499 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms