RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 MS4A18H0YCH9 400 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 IFNA7P01567 189 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 GIMD1P0DJR0 217 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 DLX5P56178 289 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 RAP1BP61224 184 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 RAP1AP62834 184 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PUDPQ08623 228 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MELKQ14680 651 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CSRP2Q16527 193 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PCK2Q16822 640 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MS4A18Q3C1V0 323 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ST8SIA1Q92185 356 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF69Q9UC07 566 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 OR2M5A3KFT3 312 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 WNT11O96014 354 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 HLA-DOBP13765 273 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SSTR2P30874 369 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 RAP2BP61225 183 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CAMK2BQ13554 666 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 OR7E24Q6IFN5 339 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 OR8H3Q8N146 312 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 FTMTQ8N4E7 242 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SLC26A10Q8NG04 563 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MARVELD3Q96A59 401 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CA10Q9NS85 328 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CKLFQ9UBR5 152 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.55■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1W2PPC1 479 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 RAD1O60671 282 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SNAPC5O75971 98 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TOXO94900 526 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CD2P06729 351 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 IGFBP4P22692 258 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 STT3BQ8TCJ2 826 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 R4GMQ9 66 aa15.54■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1W2PQ72 361 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PLSCR5A0PG75 271 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 KDM4BO94953 1096 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MPZL1O95297 269 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ISG15P05161 165 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 FBXO45P0C2W1 286 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PRSS3P35030 304 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MDGA2Q7Z553 956 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 ASB10Q8WXI3 467 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 FOXQ1Q9C009 403 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 MYF5P13349 255 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 IL11P20809 199 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 TSPAN5P62079 268 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 KDM8Q8N371 416 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 GPX8Q8TED1 209 aa15.53■□□□□ 0.08
CLDN11-201ENST00000064724 RBP7Q96R05 134 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms