RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mpeg1A1L314 713 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem38aQ3TMP8 298 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf170Q8CBG9 286 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sulf2Q8CFG0 875 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Timd2Q8R183 305 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r20K7N778 303 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r31L7N2F1 303 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rcor3Q6PGA0 451 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbpl2Q6SJ95 350 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Elfn1Q8C8T7 828 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sco2Q8VCL2 255 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arv1Q9D0U9 266 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd302Q9DCG2 228 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm5519D3Z175 170 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1425K7N659 312 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr209L7N1X3 305 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmprss7Q8BIK6 829 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1426Q8VG74 311 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700020A23RikQ9DA59 131 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13769A2ATW2 309 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr225E9PWF9 419 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Amy1P00687 511 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pax4P32115 349 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adra1aP97718 466 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stk35Q80ZW0 539 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8BZE1 841 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arl13aQ9D416 372 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tdrd6P61407 2134 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sh2b3O09039 548 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsd3b3P26150 373 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NppcQ61839 126 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc29a3Q99P65 475 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Emc7Q9EP72 241 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tpi1P17751 299 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PxkQ8BX57 582 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lpcat3Q91V01 487 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdca5Q9CPY3 264 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Supt7lQ9CZV5 412 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bin3Q9JI08 253 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc22a21Q9WTN6 564 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lao1B1ARV3 523 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sftpa1P35242 248 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PfplQ5RKV8 702 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lefty1Q64280 368 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem268Q8R239 342 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r208Q8R275 308 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem19Q91W52 336 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr587-ps1A0A1B0GSS1 159 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SvaE9PX96 165 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RbpjlO08674 515 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tgfb1P04202 390 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RetP35546 1115 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q5SPV6 233 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim23Q8BGX0 574 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LsampQ8BLK3 341 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc16a14Q8K1C7 512 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fyttd1Q91Z49 317 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q99KU6 348 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nr1h5E9Q5A6 505 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnajb5O89114 348 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tgm6Q8BM11 706 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smco4Q9JIS3 59 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr585E9PXW4 318 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3685J3QPP2 205 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd83O88324 196 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wnt4P22724 351 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2-M10.3Q85ZW6 330 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1163Q8VFR4 316 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr815Q8VFU0 316 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GabarapQ9DCD6 117 aa16.11■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr66F8VQ01 311 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Man2b2O54782 1018 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Il1r1P13504 576 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cass4Q08EC4 804 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr229Q8VFN5 307 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc22a7Q91WU2 540 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prr11Q8BHE0 368 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DpcdQ8BPA8 203 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SpartQ8R1X6 671 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd300ld4A2A7W1 245 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbp4Q00724 201 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pex11gQ6P6M5 241 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr448Q8VES9 310 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Thyn1Q91YJ3 226 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Actr6Q9D864 396 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10376D3YXI8 184 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gfra3O35118 397 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd99l2Q8BIF0 237 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ntng1Q8R4G0 539 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Glb1lQ8VC60 646 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms