RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	AOX1	Q06278	1338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TDO2	P48775	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	POLA2	Q14181	598 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GUL7	405 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PRC1	O43663	620 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP21A2	P08686	494 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CRB1	P82279	1406 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF5L	O75529	589 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	NAPB	Q9H115	298 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	RAD21	O60216	631 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF75D	P51815	510 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC14	Q96N46	770 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXB7	P09629	217 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	CTAGE5	O15320	804 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SCRN1	Q12765	414 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	UBXN4	Q92575	508 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SPTLC2	O15270	562 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	SYK	P43405	635 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-223	ENST00000639525	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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