RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620182.4

CPEB1-218, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPEB1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-218ENST00000620182 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.23■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.23■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 A0A1B0GUL7 405 aa25.22■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.22■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.22■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 F13A1P00488 732 aa25.22■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 GOLIM4O00461 696 aa25.21■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.21■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 AFF2P51816 1311 aa25.21■■□□□ 1.63
CPEB1-218ENST00000620182 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.2■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 DDB1Q16531 1140 aa25.2■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.2■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CSF1RP07333 972 aa25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 USP48Q86UV5 1035 aa25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 FAM89AQ96GI7 184 aa25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 NEK1Q96PY6 1258 aa25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 ST3GAL1Q11201 340 aa25.18■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 NECAB1Q8N987 351 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 ITGB4P16144 1822 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 PDCP20941 246 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 MTMR6Q9Y217 621 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.17■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.16■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 GORABQ5T7V8 394 aa25.16■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 SPEF2Q9C093 1822 aa25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 PHF14O94880 888 aa25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 NLRP10Q86W26 655 aa25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 ATRNO75882 1429 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 SYCE3A1L190 88 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CHGBP05060 677 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CYP21A2P08686 494 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.14■■□□□ 1.62
CPEB1-218ENST00000620182 HLFQ16534 295 aa25.14■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.14■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 XAGE2Q96GT9 111 aa25.13■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.13■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 GPTP24298 496 aa25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 UBE2HP62256 183 aa25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 RBSNQ9H1K0 784 aa25.12■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ABCC12Q96J65 1359 aa25.11■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.11■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.1■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 CTSWP56202 376 aa25.1■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.1■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ITGA6P23229 1130 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 Q6ZUG5 572 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 MAST3O60307 1309 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 METTL24Q5JXM2 366 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 ADORA1P30542 326 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 GTF3C6Q969F1 213 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-218ENST00000620182 FIBPO43427 364 aa25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-218ENST00000620182 ATP2B3Q16720 1220 aa25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-218ENST00000620182 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-218ENST00000620182 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.07■■□□□ 1.6
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