RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 NECTIN2Q92692 538 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 MBIPQ9NS73 344 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 IFT57Q9NWB7 429 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.84■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.84■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 GGA3Q9NZ52 723 aa24.84■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.83■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF853P0CG23 659 aa24.83■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 NLRP10Q86W26 655 aa24.83■■□□□ 1.57
SGMS1-208ENST00000608287 C6orf229H3BNL8 230 aa24.82■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 ECE2O60344 883 aa24.82■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.82■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 CDCA5Q96FF9 252 aa24.82■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 DLK2Q6UY11 383 aa24.81■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 ANXA1P04083 346 aa24.8■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 PDIA6Q15084 440 aa24.8■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC27Q2M243 656 aa24.8■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 PROSER3Q2NL68 480 aa24.8■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 G3V3G9 751 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 EGFRP00533 1210 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 HOXB7P09629 217 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 TCIRG1Q13488 830 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 WWC1Q8IX03 1113 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 RIMBP2O15034 1052 aa24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF609O15014 1411 aa24.78■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 TAF1P21675 1872 aa24.77■■□□□ 1.56
SGMS1-208ENST00000608287 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.76■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.76■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 RTL9Q8NET4 1388 aa24.76■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 COPS6Q7L5N1 327 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 SREBF2Q12772 1141 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 POLLQ9UGP5 575 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 GPR25O00155 361 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 NF2P35240 595 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 GPSM2P81274 684 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 SCARF1Q14162 830 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 DOK7Q18PE1 504 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D8O95759 1140 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 TM4SF4P48230 202 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-208ENST00000608287 IL16Q14005 1332 aa24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 FKTNO75072 461 aa24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 SCN9AQ15858 1988 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 PSME4Q14997 1843 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 ALDH1A1P00352 501 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L8P0C7I0 530 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 HYPKQ9NX55 129 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 WDR63Q8IWG1 891 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 GGA1Q9UJY5 639 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 UFL1O94874 794 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 TSPYL6Q8N831 410 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 MMP14P50281 582 aa24.64■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.64■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 FAM89AQ96GI7 184 aa24.64■■□□□ 1.54
SGMS1-208ENST00000608287 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 CCER2I3L3R5 266 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.62■■□□□ 1.53
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